Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRYD3Q8NCJ5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms