Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms