Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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