Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Setbp1Q9Z180 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Setbp1Q9Z180 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setbp1Q9Z180 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Setbp1Q9Z180 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Setbp1Q9Z180 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Setbp1Q9Z180 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Setbp1Q9Z180 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Setbp1Q9Z180 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Setbp1Q9Z180 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Setbp1Q9Z180 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Setbp1Q9Z180 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms