Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChtopQ9CY57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChtopQ9CY57 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms