Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gadd45gip1Q9CR59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadd45gip1Q9CR59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gadd45gip1Q9CR59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gadd45gip1Q9CR59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms