Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Gadd45gip1Q9CR59 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Gadd45gip1Q9CR59 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Gadd45gip1Q9CR59 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Gadd45gip1Q9CR59 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gadd45gip1Q9CR59 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gadd45gip1Q9CR59 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gadd45gip1Q9CR59 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Gadd45gip1Q9CR59 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gadd45gip1Q9CR59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Gadd45gip1Q9CR59 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gadd45gip1Q9CR59 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gadd45gip1Q9CR59 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gadd45gip1Q9CR59 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Gadd45gip1Q9CR59 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gadd45gip1Q9CR59 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gadd45gip1Q9CR59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gadd45gip1Q9CR59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gadd45gip1Q9CR59 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gadd45gip1Q9CR59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Gadd45gip1Q9CR59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gadd45gip1Q9CR59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Gadd45gip1Q9CR59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gadd45gip1Q9CR59 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gadd45gip1Q9CR59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gadd45gip1Q9CR59 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gadd45gip1Q9CR59 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Gadd45gip1Q9CR59 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gadd45gip1Q9CR59 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gadd45gip1Q9CR59 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gadd45gip1Q9CR59 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gadd45gip1Q9CR59 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gadd45gip1Q9CR59 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Gadd45gip1Q9CR59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gadd45gip1Q9CR59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gadd45gip1Q9CR59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gadd45gip1Q9CR59 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gadd45gip1Q9CR59 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Gadd45gip1Q9CR59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gadd45gip1Q9CR59 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gadd45gip1Q9CR59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gadd45gip1Q9CR59 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gadd45gip1Q9CR59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gadd45gip1Q9CR59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gadd45gip1Q9CR59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gadd45gip1Q9CR59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gadd45gip1Q9CR59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Gadd45gip1Q9CR59 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gadd45gip1Q9CR59 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gadd45gip1Q9CR59 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gadd45gip1Q9CR59 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gadd45gip1Q9CR59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gadd45gip1Q9CR59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gadd45gip1Q9CR59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gadd45gip1Q9CR59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gadd45gip1Q9CR59 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gadd45gip1Q9CR59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gadd45gip1Q9CR59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gadd45gip1Q9CR59 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gadd45gip1Q9CR59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gadd45gip1Q9CR59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gadd45gip1Q9CR59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gadd45gip1Q9CR59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gadd45gip1Q9CR59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gadd45gip1Q9CR59 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gadd45gip1Q9CR59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gadd45gip1Q9CR59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gadd45gip1Q9CR59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gadd45gip1Q9CR59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms