Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx32Q80ZJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx32Q80ZJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx32Q80ZJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx32Q80ZJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx32Q80ZJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx32Q80ZJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx32Q80ZJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx32Q80ZJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms