Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrn2Q6PHP6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrn2Q6PHP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrn2Q6PHP6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrn2Q6PHP6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms