Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Lrrn2Q6PHP6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lrrn2Q6PHP6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lrrn2Q6PHP6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrrn2Q6PHP6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lrrn2Q6PHP6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lrrn2Q6PHP6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Lrrn2Q6PHP6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Lrrn2Q6PHP6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrrn2Q6PHP6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrrn2Q6PHP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrrn2Q6PHP6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrrn2Q6PHP6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lrrn2Q6PHP6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lrrn2Q6PHP6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrrn2Q6PHP6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lrrn2Q6PHP6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lrrn2Q6PHP6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lrrn2Q6PHP6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lrrn2Q6PHP6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Lrrn2Q6PHP6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrrn2Q6PHP6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrrn2Q6PHP6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrn2Q6PHP6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrn2Q6PHP6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrn2Q6PHP6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lrrn2Q6PHP6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrn2Q6PHP6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrn2Q6PHP6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrn2Q6PHP6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrn2Q6PHP6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrrn2Q6PHP6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrn2Q6PHP6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrrn2Q6PHP6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrrn2Q6PHP6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrrn2Q6PHP6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lrrn2Q6PHP6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lrrn2Q6PHP6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lrrn2Q6PHP6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lrrn2Q6PHP6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Lrrn2Q6PHP6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lrrn2Q6PHP6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Lrrn2Q6PHP6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Lrrn2Q6PHP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Lrrn2Q6PHP6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Lrrn2Q6PHP6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Lrrn2Q6PHP6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Lrrn2Q6PHP6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lrrn2Q6PHP6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lrrn2Q6PHP6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrn2Q6PHP6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrn2Q6PHP6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrn2Q6PHP6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lrrn2Q6PHP6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Lrrn2Q6PHP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrrn2Q6PHP6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lrrn2Q6PHP6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lrrn2Q6PHP6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lrrn2Q6PHP6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lrrn2Q6PHP6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lrrn2Q6PHP6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lrrn2Q6PHP6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lrrn2Q6PHP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lrrn2Q6PHP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lrrn2Q6PHP6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lrrn2Q6PHP6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lrrn2Q6PHP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lrrn2Q6PHP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Lrrn2Q6PHP6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Lrrn2Q6PHP6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrn2Q6PHP6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lrrn2Q6PHP6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lrrn2Q6PHP6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lrrn2Q6PHP6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lrrn2Q6PHP6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lrrn2Q6PHP6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lrrn2Q6PHP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lrrn2Q6PHP6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lrrn2Q6PHP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lrrn2Q6PHP6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrrn2Q6PHP6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lrrn2Q6PHP6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lrrn2Q6PHP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrn2Q6PHP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrn2Q6PHP6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
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