Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC85BQ15834 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC85BQ15834 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC85BQ15834 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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