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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
tL(UAA)B2
tL(UAA)B2
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
tL(UAA)D
tL(UAA)D
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
SUP51
tL(UAA)J
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
tL(UAA)K
tL(UAA)K
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
tL(UAA)L
tL(UAA)L
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
tL(UAA)N
tL(UAA)N
84 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
MTR3
YGR158C
753 nt
7.14
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
TDP1
YBR223C
1635 nt
7.13
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
THR1
YHR025W
1074 nt
7.13
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
RMA1
YKL132C
1293 nt
7.13
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
CIT2
YCR005C
1383 nt
7.12
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
IRC5
YFR038W
2562 nt
7.12
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
DMC1
YER179W
1005 nt
7.12
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
YTH1
YPR107C
627 nt
7.12
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
YJL045W
YJL045W
1905 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
MCH2
YKL221W
1422 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
KIN1
YDR122W
3195 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
PAM17
YKR065C
594 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
RIB1
YBL033C
1038 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
ARC35
YNR035C
1029 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
NDE1
YMR145C
1683 nt
7.11
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
AMN1
YBR158W
1650 nt
7.1
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
SEC23
YPR181C
2307 nt
7.1
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
MIX17
YMR002W
471 nt
7.1
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
DPM1
YPR183W
804 nt
7.1
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
CTA1
YDR256C
1548 nt
7.1
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
CEM1
YER061C
1329 nt
7.09
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
DLD1
YDL174C
1764 nt
7.09
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
EFM1
YHL039W
1758 nt
7.09
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
CYB2
YML054C
1776 nt
7.09
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
FCP1
YMR277W
2199 nt
7.09
□□□□□ -1.27
SPE4
Q12455
ERS1
YCR075C
783 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
DOC1
YGL240W
753 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
CSM2
YIL132C
642 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
FUS3
YBL016W
1062 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
YML122C
YML122C
381 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
ADH6
YMR318C
1083 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
PAU21
YOR394W
495 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
PAU22
YPL282C
495 nt
7.08
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
HXT13
YEL069C
1695 nt
7.07
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
HPT1
YDR399W
666 nt
7.07
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
MSG5
YNL053W
1470 nt
7.06
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
RTG2
YGL252C
1767 nt
7.06
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
MRPL28
YDR462W
444 nt
7.06
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
NTG1
YAL015C
1200 nt
7.06
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
PET494
YNR045W
1470 nt
7.05
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
ADE2
YOR128C
1716 nt
7.05
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
YCR049C
YCR049C
447 nt
7.05
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
RQC1
YDR333C
2172 nt
7.05
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
TAH11
YJR046W
1815 nt
7.04
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
PUS5
YLR165C
765 nt
7.04
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
RTC4
YNL254C
1206 nt
7.04
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
YBR241C
YBR241C
1467 nt
7.04
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
YOR389W
YOR389W
1875 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
RPL2B
YIL018W
765 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
YLR358C
YLR358C
564 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SPE4
Q12455
FHN1
YGR131W
525 nt
7.02
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
HBN1
YCL026C-B
582 nt
7.02
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
CCT3
YJL014W
1605 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
GSH1
YJL101C
2037 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
NFS1
YCL017C
1494 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YOL099C
YOL099C
492 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
SGV1
YPR161C
1974 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YPQ2
YDR352W
954 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
TRR1
YDR353W
960 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YGR139W
YGR139W
339 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
GPH1
YPR160W
2709 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
MPE1
YKL059C
1326 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
TUF1
YOR187W
1314 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YEL023C
YEL023C
2049 nt
7
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YAL045C
YAL045C
309 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
RDN5-2
RDN5-2
119 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
RDN5-3
RDN5-3
119 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
RDN5-4
RDN5-4
119 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
RDN5-5
RDN5-5
119 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
ADE5,7
YGL234W
2409 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
KDX1
YKL161C
1302 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
TUB1
YML085C
1344 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
GCD11
YER025W
1584 nt
6.98
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YOR343C
YOR343C
327 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
PAC2
YER007W
1557 nt
6.96
□□□□□ -1.29
SPE4
Q12455
YAL016C-A
YAL016C-A
315 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
MEU1
YLR017W
1014 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
ATP23
YNR020C
813 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
SSC1
YJR045C
1965 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
PLB2
YMR006C
2121 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YLL066C
YLL066C
3618 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
RRN10
YBL025W
438 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
DML1
YMR211W
1428 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YPL277C
YPL277C
1464 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
COX16
YJL003W
357 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YNR014W
YNR014W
639 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
CDC13
YDL220C
2775 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YPL247C
YPL247C
1572 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
RGD2
YFL047W
2145 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
OPI11
YPR044C
354 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
YPR130C
YPR130C
408 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
BRN1
YBL097W
2265 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SPE4
Q12455
ECM10
YEL030W
1935 nt
6.92
□□□□□ -1.3
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