Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 MTR3YGR158C 753 nt7.14□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 TDP1YBR223C 1635 nt7.13□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 THR1YHR025W 1074 nt7.13□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 RMA1YKL132C 1293 nt7.13□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 CIT2YCR005C 1383 nt7.12□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 IRC5YFR038W 2562 nt7.12□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 DMC1YER179W 1005 nt7.12□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 YTH1YPR107C 627 nt7.12□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 YJL045WYJL045W 1905 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 MCH2YKL221W 1422 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 KIN1YDR122W 3195 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 PAM17YKR065C 594 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 RIB1YBL033C 1038 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 ARC35YNR035C 1029 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 NDE1YMR145C 1683 nt7.11□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 AMN1YBR158W 1650 nt7.1□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 SEC23YPR181C 2307 nt7.1□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 MIX17YMR002W 471 nt7.1□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 DPM1YPR183W 804 nt7.1□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 CTA1YDR256C 1548 nt7.1□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 CEM1YER061C 1329 nt7.09□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 DLD1YDL174C 1764 nt7.09□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 EFM1YHL039W 1758 nt7.09□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 CYB2YML054C 1776 nt7.09□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 FCP1YMR277W 2199 nt7.09□□□□□ -1.27
SPE4Q12455 ERS1YCR075C 783 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 DOC1YGL240W 753 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 CSM2YIL132C 642 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 FUS3YBL016W 1062 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 YML122CYML122C 381 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 ADH6YMR318C 1083 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 PAU21YOR394W 495 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 PAU22YPL282C 495 nt7.08□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 HXT13YEL069C 1695 nt7.07□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 HPT1YDR399W 666 nt7.07□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 MSG5YNL053W 1470 nt7.06□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 RTG2YGL252C 1767 nt7.06□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 MRPL28YDR462W 444 nt7.06□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 NTG1YAL015C 1200 nt7.06□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 PET494YNR045W 1470 nt7.05□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 ADE2YOR128C 1716 nt7.05□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 YCR049CYCR049C 447 nt7.05□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 RQC1YDR333C 2172 nt7.05□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 TAH11YJR046W 1815 nt7.04□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 PUS5YLR165C 765 nt7.04□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 RTC4YNL254C 1206 nt7.04□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 YBR241CYBR241C 1467 nt7.04□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 YOR389WYOR389W 1875 nt7.03□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 RPL2BYIL018W 765 nt7.03□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 YLR358CYLR358C 564 nt7.03□□□□□ -1.28
SPE4Q12455 FHN1YGR131W 525 nt7.02□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 HBN1YCL026C-B 582 nt7.02□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 CCT3YJL014W 1605 nt7.01□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 GSH1YJL101C 2037 nt7.01□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 NFS1YCL017C 1494 nt7.01□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YOL099CYOL099C 492 nt7.01□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 SGV1YPR161C 1974 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YPQ2YDR352W 954 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 TRR1YDR353W 960 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YGR139WYGR139W 339 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 GPH1YPR160W 2709 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 MPE1YKL059C 1326 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 TUF1YOR187W 1314 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YEL023CYEL023C 2049 nt7□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YAL045CYAL045C 309 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 KDX1YKL161C 1302 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 TUB1YML085C 1344 nt6.99□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 GCD11YER025W 1584 nt6.98□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YOR343CYOR343C 327 nt6.97□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 PAC2YER007W 1557 nt6.96□□□□□ -1.29
SPE4Q12455 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.96□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 MEU1YLR017W 1014 nt6.96□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 ATP23YNR020C 813 nt6.96□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 SSC1YJR045C 1965 nt6.96□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 PLB2YMR006C 2121 nt6.95□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 YLL066CYLL066C 3618 nt6.95□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 RRN10YBL025W 438 nt6.95□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 DML1YMR211W 1428 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 YPL277CYPL277C 1464 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 COX16YJL003W 357 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 YNR014WYNR014W 639 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 CDC13YDL220C 2775 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 YPL247CYPL247C 1572 nt6.94□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 RGD2YFL047W 2145 nt6.93□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 OPI11YPR044C 354 nt6.93□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 SMK1YPR054W 1167 nt6.93□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 YPR130CYPR130C 408 nt6.93□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 BRN1YBL097W 2265 nt6.93□□□□□ -1.3
SPE4Q12455 ECM10YEL030W 1935 nt6.92□□□□□ -1.3
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