Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 RFS1YBR052C 633 nt6.35□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 FRE5YOR384W 2085 nt6.35□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 ENB1YOL158C 1821 nt6.34□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 YGL260WYGL260W 231 nt6.34□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 RRP46YGR095C 672 nt6.34□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 YKL147CYKL147C 618 nt6.34□□□□□ -1.39
VAM3Q12241 STE3YKL178C 1413 nt6.33□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 SSC1YJR045C 1965 nt6.33□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 PSP2YML017W 1782 nt6.33□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YCR041WYCR041W 333 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 OPI1YHL020C 1215 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 CSM2YIL132C 642 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 LOT6YLR011W 576 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 INP54YOL065C 1155 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 PAU21YOR394W 495 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 PAU22YPL282C 495 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 ECM30YLR436C 3825 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 BUD9YGR041W 1644 nt6.32□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 GET2YER083C 858 nt6.31□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 LIP5YOR196C 1245 nt6.31□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 FCY2YER056C 1602 nt6.31□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 NUP53YMR153W 1428 nt6.31□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 FET4YMR319C 1659 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 REC114YMR133W 1287 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 CPT1YNL130C 1182 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 AFG3YER017C 2286 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 GDA1YEL042W 1557 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YNL295WYNL295W 1575 nt6.3□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 SPR1YOR190W 1338 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 SNF4YGL115W 969 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 AIM2YAL049C 741 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 ADE1YAR015W 921 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 POX1YGL205W 2247 nt6.29□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 NUP57YGR119C 1626 nt6.28□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 URH1YDR400W 1023 nt6.28□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 ATG17YLR423C 1254 nt6.28□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 YOR389WYOR389W 1875 nt6.28□□□□□ -1.4
VAM3Q12241 CDC3YLR314C 1563 nt6.27□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 PPS1YBR276C 2424 nt6.27□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 RRP43YCR035C 1185 nt6.27□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 PNS1YOR161C 1620 nt6.27□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 ELP3YPL086C 1674 nt6.26□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 HAC1YFL031W 717 nt6.26□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 YLR112WYLR112W 420 nt6.26□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 YOR343CYOR343C 327 nt6.26□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 BDS1YOL164W 1941 nt6.26□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 PAC10YGR078C 600 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 ERP2YAL007C 648 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 YOR012WYOR012W 414 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 ATP4YPL078C 735 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 YPT10YBR264C 600 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 GYP8YFL027C 1494 nt6.25□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.24□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 MHP1YJL042W 4197 nt6.23□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 PPZ2YDR436W 2133 nt6.23□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 NMT1YLR195C 1368 nt6.22□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 YDR476CYDR476C 675 nt6.22□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 SRF1YDL133W 1314 nt6.22□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 TOS1YBR162C 1368 nt6.21□□□□□ -1.41
VAM3Q12241 EXG2YDR261C 1689 nt6.21□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 LCP5YER127W 1074 nt6.21□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 BNS1YGR230W 414 nt6.21□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 FUS3YBL016W 1062 nt6.21□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 DSC3YOR223W 879 nt6.21□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 PSA1YDL055C 1086 nt6.2□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 HHY1YEL059W 309 nt6.2□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 BUD20YLR074C 501 nt6.2□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 ERV2YPR037C 591 nt6.2□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SPS1YDR523C 1473 nt6.2□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SLX5YDL013W 1860 nt6.19□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 STS1YIR011C 960 nt6.19□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SUN4YNL066W 1263 nt6.19□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 YBR284WYBR284W 2394 nt6.18□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 EMP65YER140W 1671 nt6.18□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 TPK1YJL164C 1194 nt6.18□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 YJL211CYJL211C 444 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 HMS2YJR147W 1077 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 OST3YOR085W 1053 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 RDR1YOR380W 1641 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SPS22YCL048W 1392 nt6.17□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 CHS5YLR330W 2016 nt6.16□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 CDC7YDL017W 1524 nt6.16□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.16□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 MCH2YKL221W 1422 nt6.16□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 PET494YNR045W 1470 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SKY1YMR216C 2229 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 KIN1YDR122W 3195 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 ORM1YGR038W 669 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 MTR3YGR158C 753 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 YJR142WYJR142W 1029 nt6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 96 ms