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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
RFS1
YBR052C
633 nt
6.35
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
FRE5
YOR384W
2085 nt
6.35
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
ENB1
YOL158C
1821 nt
6.34
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
YGL260W
YGL260W
231 nt
6.34
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
RRP46
YGR095C
672 nt
6.34
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
YKL147C
YKL147C
618 nt
6.34
□□□□□ -1.39
VAM3
Q12241
STE3
YKL178C
1413 nt
6.33
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
SSC1
YJR045C
1965 nt
6.33
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
PSP2
YML017W
1782 nt
6.33
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YCR041W
YCR041W
333 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YGR068W-A
YGR068W-A
96 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
OPI1
YHL020C
1215 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
CSM2
YIL132C
642 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
LOT6
YLR011W
576 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
INP54
YOL065C
1155 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
PAU21
YOR394W
495 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
PAU22
YPL282C
495 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
ECM30
YLR436C
3825 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
BUD9
YGR041W
1644 nt
6.32
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
GET2
YER083C
858 nt
6.31
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
LIP5
YOR196C
1245 nt
6.31
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
FCY2
YER056C
1602 nt
6.31
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
NUP53
YMR153W
1428 nt
6.31
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
FET4
YMR319C
1659 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YML034C-A
YML034C-A
399 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
REC114
YMR133W
1287 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
CPT1
YNL130C
1182 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
AFG3
YER017C
2286 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
GDA1
YEL042W
1557 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YNL295W
YNL295W
1575 nt
6.3
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
SPR1
YOR190W
1338 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YEL009C-A
YEL009C-A
408 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
SNF4
YGL115W
969 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
AIM2
YAL049C
741 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
ADE1
YAR015W
921 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
POX1
YGL205W
2247 nt
6.29
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
NUP57
YGR119C
1626 nt
6.28
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
URH1
YDR400W
1023 nt
6.28
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
ATG17
YLR423C
1254 nt
6.28
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
YOR389W
YOR389W
1875 nt
6.28
□□□□□ -1.4
VAM3
Q12241
CDC3
YLR314C
1563 nt
6.27
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
PPS1
YBR276C
2424 nt
6.27
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
RRP43
YCR035C
1185 nt
6.27
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
PNS1
YOR161C
1620 nt
6.27
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
ELP3
YPL086C
1674 nt
6.26
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
HAC1
YFL031W
717 nt
6.26
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
YLR112W
YLR112W
420 nt
6.26
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
YOR343C
YOR343C
327 nt
6.26
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
BDS1
YOL164W
1941 nt
6.26
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
PAC10
YGR078C
600 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
ERP2
YAL007C
648 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
YOR012W
YOR012W
414 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
ATP4
YPL078C
735 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
YPT10
YBR264C
600 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
GYP8
YFL027C
1494 nt
6.25
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)B1
tL(UAA)B1
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)B2
tL(UAA)B2
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)D
tL(UAA)D
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
SUP51
tL(UAA)J
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)K
tL(UAA)K
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)L
tL(UAA)L
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
tL(UAA)N
tL(UAA)N
84 nt
6.24
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
MHP1
YJL042W
4197 nt
6.23
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
PPZ2
YDR436W
2133 nt
6.23
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
NMT1
YLR195C
1368 nt
6.22
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
YDR476C
YDR476C
675 nt
6.22
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
SRF1
YDL133W
1314 nt
6.22
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
TOS1
YBR162C
1368 nt
6.21
□□□□□ -1.41
VAM3
Q12241
EXG2
YDR261C
1689 nt
6.21
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
LCP5
YER127W
1074 nt
6.21
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
BNS1
YGR230W
414 nt
6.21
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
FUS3
YBL016W
1062 nt
6.21
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
DSC3
YOR223W
879 nt
6.21
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
PSA1
YDL055C
1086 nt
6.2
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
HHY1
YEL059W
309 nt
6.2
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
BUD20
YLR074C
501 nt
6.2
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
ERV2
YPR037C
591 nt
6.2
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SPS1
YDR523C
1473 nt
6.2
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SLX5
YDL013W
1860 nt
6.19
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
STS1
YIR011C
960 nt
6.19
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SUN4
YNL066W
1263 nt
6.19
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
YBR284W
YBR284W
2394 nt
6.18
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
EMP65
YER140W
1671 nt
6.18
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
TPK1
YJL164C
1194 nt
6.18
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
YAL016C-A
YAL016C-A
315 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
YJL211C
YJL211C
444 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
HMS2
YJR147W
1077 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
OST3
YOR085W
1053 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
RDR1
YOR380W
1641 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SPS22
YCL048W
1392 nt
6.17
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
CHS5
YLR330W
2016 nt
6.16
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
CDC7
YDL017W
1524 nt
6.16
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
6.16
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
MCH2
YKL221W
1422 nt
6.16
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
PET494
YNR045W
1470 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SKY1
YMR216C
2229 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
KIN1
YDR122W
3195 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
ORM1
YGR038W
669 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
MTR3
YGR158C
753 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
YJR142W
YJR142W
1029 nt
6.15
□□□□□ -1.42
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