Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 BIM1YER016W 1035 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 PIH1YHR034C 1035 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 LIP5YOR196C 1245 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 SDH8YBR269C 417 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 ERR3YMR323W 1314 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 ERR1YOR393W 1314 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 ERR2YPL281C 1314 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 ATO2YNR002C 849 nt6.19□□□□□ -1.42
USB1Q12208 HOG1YLR113W 1308 nt6.19□□□□□ -1.42
USB1Q12208 MHP1YJL042W 4197 nt6.18□□□□□ -1.42
USB1Q12208 ATP23YNR020C 813 nt6.18□□□□□ -1.42
USB1Q12208 RPL43AYPR043W 279 nt6.18□□□□□ -1.42
USB1Q12208 TUB1YML085C 1344 nt6.18□□□□□ -1.42
USB1Q12208 FLC2YAL053W 2352 nt6.17□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YMR074CYMR074C 438 nt6.16□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YMR253CYMR253C 1245 nt6.16□□□□□ -1.42
USB1Q12208 FCP1YMR277W 2199 nt6.16□□□□□ -1.42
USB1Q12208 RGT2YDL138W 2292 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 CDC7YDL017W 1524 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 PRB1YEL060C 1908 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YBL111CYBL111C 2004 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 RPR1RPR1 369 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 DPM1YPR183W 804 nt6.15□□□□□ -1.42
USB1Q12208 DML1YMR211W 1428 nt6.15□□□□□ -1.43
USB1Q12208 RDR1YOR380W 1641 nt6.14□□□□□ -1.43
USB1Q12208 PUP2YGR253C 783 nt6.14□□□□□ -1.43
USB1Q12208 PTH2YBL057C 627 nt6.14□□□□□ -1.43
USB1Q12208 RMD8YFR048W 1989 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YKR018CYKR018C 2178 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YML079WYML079W 606 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 MPE1YKL059C 1326 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 NFS1YCL017C 1494 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 POB3YML069W 1659 nt6.13□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YER137CYER137C 447 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 NUP57YGR119C 1626 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 ACO1YLR304C 2337 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 TOD6YBL054W 1578 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 SUN4YNL066W 1263 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 LAT1YNL071W 1449 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 SGE1YPR198W 1632 nt6.12□□□□□ -1.43
USB1Q12208 AQR1YNL065W 1761 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 FCY2YER056C 1602 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YCR041WYCR041W 333 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 RTC4YNL254C 1206 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 DAL4YIR028W 1908 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 SEC24YIL109C 2781 nt6.11□□□□□ -1.43
USB1Q12208 GPA1YHR005C 1419 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 TRR2YHR106W 1029 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 LOT6YLR011W 576 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 PRS4YBL068W 981 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YPL067CYPL067C 597 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 YPL247CYPL247C 1572 nt6.1□□□□□ -1.43
USB1Q12208 PGI1YBR196C 1665 nt6.09□□□□□ -1.43
USB1Q12208 ENB1YOL158C 1821 nt6.09□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YPR127WYPR127W 1038 nt6.08□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.07□□□□□ -1.44
USB1Q12208 AIM2YAL049C 741 nt6.07□□□□□ -1.44
USB1Q12208 ERG27YLR100W 1044 nt6.07□□□□□ -1.44
USB1Q12208 GET4YOR164C 939 nt6.07□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YLL058WYLL058W 1728 nt6.07□□□□□ -1.44
USB1Q12208 SNF4YGL115W 969 nt6.06□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.06□□□□□ -1.44
USB1Q12208 PHO85YPL031C 918 nt6.06□□□□□ -1.44
USB1Q12208 EXG2YDR261C 1689 nt6.06□□□□□ -1.44
USB1Q12208 AIM3YBR108W 2844 nt6.06□□□□□ -1.44
USB1Q12208 EDC3YEL015W 1656 nt6.05□□□□□ -1.44
USB1Q12208 THR1YHR025W 1074 nt6.05□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YLR112WYLR112W 420 nt6.05□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YPQ1YOL092W 927 nt6.05□□□□□ -1.44
USB1Q12208 CST26YBR042C 1194 nt6.05□□□□□ -1.44
USB1Q12208 BNA3YJL060W 1335 nt6.04□□□□□ -1.44
USB1Q12208 VTS1YOR359W 1572 nt6.03□□□□□ -1.44
USB1Q12208 DMC1YER179W 1005 nt6.03□□□□□ -1.44
USB1Q12208 HGH1YGR187C 1185 nt6.03□□□□□ -1.44
USB1Q12208 YOX1YML027W 1158 nt6.03□□□□□ -1.44
USB1Q12208 PLB2YMR006C 2121 nt6.03□□□□□ -1.44
USB1Q12208 MIX17YMR002W 471 nt6.02□□□□□ -1.45
USB1Q12208 DLD1YDL174C 1764 nt6.02□□□□□ -1.45
USB1Q12208 UME1YPL139C 1383 nt6.02□□□□□ -1.45
USB1Q12208 TDP1YBR223C 1635 nt6.02□□□□□ -1.45
USB1Q12208 NAS6YGR232W 687 nt6.01□□□□□ -1.45
USB1Q12208 RFS1YBR052C 633 nt6.01□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YPR130CYPR130C 408 nt6.01□□□□□ -1.45
USB1Q12208 ICL2YPR006C 1728 nt6.01□□□□□ -1.45
USB1Q12208 COS10YNR075W 1125 nt6□□□□□ -1.45
USB1Q12208 HTZ1YOL012C 405 nt6□□□□□ -1.45
USB1Q12208 VBA5YKR105C 1749 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 BRN1YBL097W 2265 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YCR049CYCR049C 447 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 CIA1YDR267C 993 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 MBF1YOR298C-A 456 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 SNT309YPR101W 528 nt5.99□□□□□ -1.45
USB1Q12208 NAF1YNL124W 1479 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 HPT1YDR399W 666 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 MTR3YGR158C 753 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 AIM46YHR199C 933 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YAL045CYAL045C 309 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 URA1YKL216W 945 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YNR005CYNR005C 405 nt5.98□□□□□ -1.45
USB1Q12208 AGP2YBR132C 1791 nt5.98□□□□□ -1.45
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