Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 ADE17YMR120C 1779 nt6.91□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YTH1YPR107C 627 nt6.91□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 ARG7YMR062C 1326 nt6.91□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 MCH2YKL221W 1422 nt6.91□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 ERV25YML012W 636 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 LIP5YOR196C 1245 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 PAU21YOR394W 495 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YPL108WYPL108W 507 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 PAU22YPL282C 495 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 GLN3YER040W 2193 nt6.9□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 TIM50YPL063W 1431 nt6.9□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 BUD9YGR041W 1644 nt6.9□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 ARC35YNR035C 1029 nt6.89□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YOR343CYOR343C 327 nt6.89□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 TKL2YBR117C 2046 nt6.89□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 AFG3YER017C 2286 nt6.89□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 FZF1YGL254W 900 nt6.88□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 CAK1YFL029C 1107 nt6.87□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 RPL2BYIL018W 765 nt6.87□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YJL160CYJL160C 864 nt6.87□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 ECM38YLR299W 1983 nt6.87□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 EXG2YDR261C 1689 nt6.87□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 ARP3YJR065C 1350 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 ERG24YNL280C 1317 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YPT31YER031C 672 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 CPR2YHR057C 618 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 RRT14YIL127C 621 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 OPI11YPR044C 354 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YPC1YBR183W 951 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YLL066CYLL066C 3618 nt6.86□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 FCY1YPR062W 477 nt6.85□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 BDF2YDL070W 1917 nt6.85□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 YBR241CYBR241C 1467 nt6.85□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 VBA5YKR105C 1749 nt6.84□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 GSH1YJL101C 2037 nt6.84□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 FCY22YER060W-A 1593 nt6.84□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 MTR3YGR158C 753 nt6.84□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 LSP1YPL004C 1026 nt6.84□□□□□ -1.31
CIK1Q01649 SPS22YCL048W 1392 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 YAL045CYAL045C 309 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 PMU1YKL128C 888 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 SUR7YML052W 909 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 YNL200CYNL200C 741 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 GPH1YPR160W 2709 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 NMD5YJR132W 3147 nt6.83□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 DAL80YKR034W 810 nt6.82□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 NSE5YML023C 1671 nt6.81□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 TAH11YJR046W 1815 nt6.81□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 MHP1YJL042W 4197 nt6.81□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.81□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 PUS5YLR165C 765 nt6.81□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 MRP1YDR347W 966 nt6.8□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 HSP12YFL014W 330 nt6.8□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 AVT4YNL101W 2142 nt6.8□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 HXT2YMR011W 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 PHO3YBR092C 1404 nt6.79□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 SNT309YPR101W 528 nt6.79□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 JHD1YER051W 1479 nt6.79□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 HOG1YLR113W 1308 nt6.78□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 ELP3YPL086C 1674 nt6.78□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 CHS5YLR330W 2016 nt6.78□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 OPI1YHL020C 1215 nt6.78□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 ATF1YOR377W 1578 nt6.78□□□□□ -1.32
CIK1Q01649 MPA43YNL249C 1629 nt6.77□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 ERS1YCR075C 783 nt6.77□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YFL052WYFL052W 1398 nt6.77□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YPR084WYPR084W 1371 nt6.77□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 FET4YMR319C 1659 nt6.77□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 KNS1YLL019C 2214 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 PET18YCR020C 648 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YER156CYER156C 1017 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 TOS1YBR162C 1368 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 CMR1YDL156W 1569 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 CEF1YMR213W 1773 nt6.76□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 FHN1YGR131W 525 nt6.75□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YMR206WYMR206W 942 nt6.75□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 SUN4YNL066W 1263 nt6.75□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 AMN1YBR158W 1650 nt6.74□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 GDH1YOR375C 1365 nt6.74□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 INP54YOL065C 1155 nt6.74□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 CCT3YJL014W 1605 nt6.74□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 ADA2YDR448W 1305 nt6.74□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 MKK1YOR231W 1527 nt6.73□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 OPI8YKR035C 642 nt6.73□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 MFT1YML062C 1179 nt6.73□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YOR268CYOR268C 399 nt6.72□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 ISC1YER019W 1434 nt6.72□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 YFR006WYFR006W 1608 nt6.72□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 BDS1YOL164W 1941 nt6.72□□□□□ -1.33
CIK1Q01649 AIM3YBR108W 2844 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 EDC2YER035W 438 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 RPS6AYPL090C 711 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 RPS6BYBR181C 711 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 HBN1YCL026C-B 582 nt6.71□□□□□ -1.34
CIK1Q01649 TDP1YBR223C 1635 nt6.71□□□□□ -1.34
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