Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	EFM1	YHL039W	1758 nt		4.65	□□□□□ -1.66
DDR2	P89113	CYB2	YML054C	1776 nt		4.65	□□□□□ -1.66
DDR2	P89113	MSG5	YNL053W	1470 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	CCR4	YAL021C	2514 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	DLD1	YDL174C	1764 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	THR1	YHR025W	1074 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	ADH6	YMR318C	1083 nt		4.64	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	NTG1	YAL015C	1200 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	FUS3	YBL016W	1062 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	YML122C	YML122C	381 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	RTC4	YNL254C	1206 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	GNP1	YDR508C	1992 nt		4.63	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	HBN1	YCL026C-B	582 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	TUB1	YML085C	1344 nt		4.62	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	RIB1	YBL033C	1038 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	IRC5	YFR038W	2562 nt		4.61	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	SMK1	YPR054W	1167 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	MPE1	YKL059C	1326 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	CCT3	YJL014W	1605 nt		4.6	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	ERS1	YCR075C	783 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	MRPL28	YDR462W	444 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	DMC1	YER179W	1005 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	RPL2B	YIL018W	765 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	HOG1	YLR113W	1308 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	SKI2	YLR398C	3864 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	ERG12	YMR208W	1332 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	VTS1	YOR359W	1572 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	NFS1	YCL017C	1494 nt		4.59	□□□□□ -1.67
DDR2	P89113	GPH1	YPR160W	2709 nt		4.59	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	GSH1	YJL101C	2037 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	EMP65	YER140W	1671 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	TOS1	YBR162C	1368 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	CEM1	YER061C	1329 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	SOD2	YHR008C	702 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		4.58	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YBR241C	YBR241C	1467 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	HPT1	YDR399W	666 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YAL045C	YAL045C	309 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PAU21	YOR394W	495 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PAU22	YPL282C	495 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	OPI11	YPR044C	354 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	CTA1	YDR256C	1548 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	DML1	YMR211W	1428 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	ARP3	YJR065C	1350 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YCR049C	YCR049C	447 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	DOC1	YGL240W	753 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YNR014W	YNR014W	639 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YOL099C	YOL099C	492 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PAC2	YER007W	1557 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YPL247C	YPL247C	1572 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	SLA2	YNL243W	2907 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	MAM3	YOL060C	2121 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	TUF1	YOR187W	1314 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	CLN1	YMR199W	1641 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PPH22	YDL188C	1134 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	COX16	YJL003W	357 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PDR18	YNR070W	4002 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PET494	YNR045W	1470 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	VBA5	YKR105C	1749 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	MLS1	YNL117W	1665 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	CTF8	YHR191C	402 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	SUR7	YML052W	909 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YMR034C	YMR034C	1305 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	TRS31	YDR472W	852 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	NCA3	YJL116C	1014 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	GCN3	YKR026C	918 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	OPI8	YKR035C	642 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	YOR343C	YOR343C	327 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DDR2	P89113	PLB2	YMR006C	2121 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	CMK2	YOL016C	1344 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	HIS1	YER055C	894 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	YAL016C-A	YAL016C-A	315 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	HMS2	YJR147W	1077 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	YLR358C	YLR358C	564 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	ATP23	YNR020C	813 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	GET4	YOR164C	939 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	ADE2	YOR128C	1716 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	GTT3	YEL017W	1014 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	BRN1	YBL097W	2265 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	YLL066C	YLL066C	3618 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	RSC4	YKR008W	1878 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	FPR2	YDR519W	408 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	PIH1	YHR034C	1035 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	PTC7	YHR076W	1032 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	SPG5	YMR191W	1122 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	PTH2	YBL057C	627 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	HTZ1	YOL012C	405 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	ACO1	YLR304C	2337 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DDR2	P89113	RGD2	YFL047W	2145 nt		4.49	□□□□□ -1.69

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