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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
MMS21
YEL019C
804 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)B1
tL(UAA)B1
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)B2
tL(UAA)B2
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)D
tL(UAA)D
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
SUP51
tL(UAA)J
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)K
tL(UAA)K
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)L
tL(UAA)L
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
tL(UAA)N
tL(UAA)N
84 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
YGL118C
YGL118C
438 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
NAT5
YOR253W
531 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
SPS1
YDR523C
1473 nt
7.55
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
POX1
YGL205W
2247 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
YDR327W
YDR327W
327 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
YOR041C
YOR041C
432 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
CDS1
YBR029C
1374 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
HNM1
YGL077C
1692 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
ITR1
YDR497C
1755 nt
7.54
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
PIC2
YER053C
903 nt
7.53
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
DPH5
YLR172C
903 nt
7.53
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
DSC3
YOR223W
879 nt
7.53
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
RBS1
YDL189W
1374 nt
7.53
□□□□□ -1.2
RTA1
P53047
APM4
YOL062C
1476 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
SEM1
YDR363W-A
270 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YNR068C
YNR068C
819 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YOR343C
YOR343C
327 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
TCB1
YOR086C
3561 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
CKI1
YLR133W
1749 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
OSM1
YJR051W
1506 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
ERG24
YNL280C
1317 nt
7.52
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
GTS1
YGL181W
1191 nt
7.51
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
BDS1
YOL164W
1941 nt
7.5
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
CHA1
YCL064C
1083 nt
7.5
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
BMT5
YIL096C
1011 nt
7.5
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
GAT1
YFL021W
1533 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
MET30
YIL046W
1923 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YIL092W
YIL092W
1902 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YJR142W
YJR142W
1029 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
FUS3
YBL016W
1062 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YNR048W
YNR048W
1182 nt
7.49
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
CDC23
YHR166C
1881 nt
7.48
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
PRY2
YKR013W
990 nt
7.48
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
YNL190W
YNL190W
615 nt
7.48
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
HST2
YPL015C
1074 nt
7.48
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
STF1
YDL130W-A
261 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
BUD20
YLR074C
501 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
ATP10
YLR393W
840 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
CRN1
YLR429W
1956 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
PET494
YNR045W
1470 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
TFC6
YDR362C
2019 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
MSS51
YLR203C
1311 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
OPT1
YJL212C
2400 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
DRS1
YLL008W
2259 nt
7.47
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
LAS17
YOR181W
1902 nt
7.46
□□□□□ -1.21
RTA1
P53047
SKP1
YDR328C
585 nt
7.46
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
HRB1
YNL004W
1365 nt
7.46
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
PAP1
YKR002W
1707 nt
7.45
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
EAF5
YEL018W
840 nt
7.45
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
NCA3
YJL116C
1014 nt
7.45
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
AFG3
YER017C
2286 nt
7.45
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
BAP3
YDR046C
1815 nt
7.45
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
BIM1
YER016W
1035 nt
7.44
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
YGL081W
YGL081W
963 nt
7.44
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
MAM3
YOL060C
2121 nt
7.44
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
MSI1
YBR195C
1269 nt
7.44
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
CHS5
YLR330W
2016 nt
7.44
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
RTG2
YGL252C
1767 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
YGL260W
YGL260W
231 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
NMA2
YGR010W
1188 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
YAL016C-A
YAL016C-A
315 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
YKL147C
YKL147C
618 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
ERR3
YMR323W
1314 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
ERR1
YOR393W
1314 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
ERR2
YPL281C
1314 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
CAN1
YEL063C
1773 nt
7.43
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
ARP10
YDR106W
855 nt
7.41
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
YER147C-A
YER147C-A
411 nt
7.41
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
PIL1
YGR086C
1020 nt
7.41
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
MRPL24
YMR193W
777 nt
7.41
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
RPL12B
YDR418W
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□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
LIP5
YOR196C
1245 nt
7.4
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
AIM41
YOR215C
558 nt
7.4
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
DIT1
YDR403W
1611 nt
7.4
□□□□□ -1.22
RTA1
P53047
IES1
YFL013C
2079 nt
7.39
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
CDC3
YLR314C
1563 nt
7.39
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
MAS2
YHR024C
1449 nt
7.39
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YJL213W
YJL213W
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7.39
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
CCW12
YLR110C
402 nt
7.39
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YLR358C
YLR358C
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RTA1
P53047
YMR253C
YMR253C
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RTA1
P53047
DSE3
YOR264W
1293 nt
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RTA1
P53047
GUT1
YHL032C
2130 nt
7.39
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RTA1
P53047
PRP40
YKL012W
1752 nt
7.38
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
MIX17
YMR002W
471 nt
7.38
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
FLC2
YAL053W
2352 nt
7.38
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YKR018C
YKR018C
2178 nt
7.37
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
RMD8
YFR048W
1989 nt
7.37
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
PRB1
YEL060C
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7.37
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
CLB4
YLR210W
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□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
YOL079W
YOL079W
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7.37
□□□□□ -1.23
RTA1
P53047
GCD11
YER025W
1584 nt
7.37
□□□□□ -1.23
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