Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 MMS21YEL019C 804 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 YGL118CYGL118C 438 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 NAT5YOR253W 531 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 SPS1YDR523C 1473 nt7.55□□□□□ -1.2
RTA1P53047 POX1YGL205W 2247 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 YDR327WYDR327W 327 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 YOR041CYOR041C 432 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 CDS1YBR029C 1374 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 HNM1YGL077C 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 ITR1YDR497C 1755 nt7.54□□□□□ -1.2
RTA1P53047 PIC2YER053C 903 nt7.53□□□□□ -1.2
RTA1P53047 DPH5YLR172C 903 nt7.53□□□□□ -1.2
RTA1P53047 DSC3YOR223W 879 nt7.53□□□□□ -1.2
RTA1P53047 RBS1YDL189W 1374 nt7.53□□□□□ -1.2
RTA1P53047 APM4YOL062C 1476 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 SEM1YDR363W-A 270 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YNR068CYNR068C 819 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YOR343CYOR343C 327 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 TCB1YOR086C 3561 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 CKI1YLR133W 1749 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 OSM1YJR051W 1506 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 ERG24YNL280C 1317 nt7.52□□□□□ -1.21
RTA1P53047 GTS1YGL181W 1191 nt7.51□□□□□ -1.21
RTA1P53047 BDS1YOL164W 1941 nt7.5□□□□□ -1.21
RTA1P53047 CHA1YCL064C 1083 nt7.5□□□□□ -1.21
RTA1P53047 BMT5YIL096C 1011 nt7.5□□□□□ -1.21
RTA1P53047 GAT1YFL021W 1533 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 MET30YIL046W 1923 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YIL092WYIL092W 1902 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YJR142WYJR142W 1029 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 FUS3YBL016W 1062 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YNR048WYNR048W 1182 nt7.49□□□□□ -1.21
RTA1P53047 CDC23YHR166C 1881 nt7.48□□□□□ -1.21
RTA1P53047 PRY2YKR013W 990 nt7.48□□□□□ -1.21
RTA1P53047 YNL190WYNL190W 615 nt7.48□□□□□ -1.21
RTA1P53047 HST2YPL015C 1074 nt7.48□□□□□ -1.21
RTA1P53047 STF1YDL130W-A 261 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 BUD20YLR074C 501 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 ATP10YLR393W 840 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 CRN1YLR429W 1956 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 PET494YNR045W 1470 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 TFC6YDR362C 2019 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 MSS51YLR203C 1311 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 OPT1YJL212C 2400 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 DRS1YLL008W 2259 nt7.47□□□□□ -1.21
RTA1P53047 LAS17YOR181W 1902 nt7.46□□□□□ -1.21
RTA1P53047 SKP1YDR328C 585 nt7.46□□□□□ -1.22
RTA1P53047 HRB1YNL004W 1365 nt7.46□□□□□ -1.22
RTA1P53047 PAP1YKR002W 1707 nt7.45□□□□□ -1.22
RTA1P53047 EAF5YEL018W 840 nt7.45□□□□□ -1.22
RTA1P53047 NCA3YJL116C 1014 nt7.45□□□□□ -1.22
RTA1P53047 AFG3YER017C 2286 nt7.45□□□□□ -1.22
RTA1P53047 BAP3YDR046C 1815 nt7.45□□□□□ -1.22
RTA1P53047 BIM1YER016W 1035 nt7.44□□□□□ -1.22
RTA1P53047 YGL081WYGL081W 963 nt7.44□□□□□ -1.22
RTA1P53047 MAM3YOL060C 2121 nt7.44□□□□□ -1.22
RTA1P53047 MSI1YBR195C 1269 nt7.44□□□□□ -1.22
RTA1P53047 CHS5YLR330W 2016 nt7.44□□□□□ -1.22
RTA1P53047 RTG2YGL252C 1767 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 YGL260WYGL260W 231 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 NMA2YGR010W 1188 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 YKL147CYKL147C 618 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 ERR3YMR323W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 ERR1YOR393W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 ERR2YPL281C 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 CAN1YEL063C 1773 nt7.43□□□□□ -1.22
RTA1P53047 ARP10YDR106W 855 nt7.41□□□□□ -1.22
RTA1P53047 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.41□□□□□ -1.22
RTA1P53047 PIL1YGR086C 1020 nt7.41□□□□□ -1.22
RTA1P53047 MRPL24YMR193W 777 nt7.41□□□□□ -1.22
RTA1P53047 RPL12BYDR418W 498 nt7.4□□□□□ -1.22
RTA1P53047 LIP5YOR196C 1245 nt7.4□□□□□ -1.22
RTA1P53047 AIM41YOR215C 558 nt7.4□□□□□ -1.22
RTA1P53047 DIT1YDR403W 1611 nt7.4□□□□□ -1.22
RTA1P53047 IES1YFL013C 2079 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 CDC3YLR314C 1563 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 MAS2YHR024C 1449 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 YJL213WYJL213W 996 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 CCW12YLR110C 402 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 YLR358CYLR358C 564 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 YMR253CYMR253C 1245 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 DSE3YOR264W 1293 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 GUT1YHL032C 2130 nt7.39□□□□□ -1.23
RTA1P53047 PRP40YKL012W 1752 nt7.38□□□□□ -1.23
RTA1P53047 MIX17YMR002W 471 nt7.38□□□□□ -1.23
RTA1P53047 FLC2YAL053W 2352 nt7.38□□□□□ -1.23
RTA1P53047 YKR018CYKR018C 2178 nt7.37□□□□□ -1.23
RTA1P53047 RMD8YFR048W 1989 nt7.37□□□□□ -1.23
RTA1P53047 PRB1YEL060C 1908 nt7.37□□□□□ -1.23
RTA1P53047 CLB4YLR210W 1383 nt7.37□□□□□ -1.23
RTA1P53047 YOL079WYOL079W 399 nt7.37□□□□□ -1.23
RTA1P53047 GCD11YER025W 1584 nt7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.9 ms