Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NeflP08551 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NeflP08551 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NeflP08551 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NeflP08551 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NeflP08551 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NeflP08551 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NeflP08551 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NeflP08551 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NeflP08551 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NeflP08551 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NeflP08551 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NeflP08551 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NeflP08551 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NeflP08551 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NeflP08551 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NeflP08551 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NeflP08551 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NeflP08551 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NeflP08551 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NeflP08551 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NeflP08551 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NeflP08551 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
NeflP08551 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NeflP08551 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NeflP08551 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NeflP08551 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NeflP08551 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NeflP08551 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NeflP08551 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NeflP08551 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NeflP08551 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NeflP08551 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NeflP08551 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NeflP08551 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NeflP08551 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NeflP08551 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NeflP08551 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NeflP08551 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NeflP08551 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NeflP08551 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NeflP08551 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NeflP08551 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NeflP08551 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NeflP08551 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NeflP08551 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NeflP08551 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NeflP08551 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NeflP08551 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NeflP08551 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NeflP08551 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NeflP08551 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NeflP08551 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NeflP08551 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NeflP08551 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NeflP08551 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NeflP08551 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NeflP08551 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NeflP08551 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NeflP08551 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NeflP08551 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NeflP08551 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NeflP08551 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms