Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VPREB3Q9UKI3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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