Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB2P55268 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB2P55268 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms