Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMG1C9JSJ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms