Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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