Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRIP3Q6Q6R5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms