Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCSO14618 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCSO14618 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCSO14618 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCSO14618 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCSO14618 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCSO14618 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCSO14618 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCSO14618 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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