Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPARGC1BQ86YN6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARGC1BQ86YN6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms