Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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EXT1Q16394 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EXT1Q16394 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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