Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB2P55268 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMB2P55268 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms