Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCSO14618 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCSO14618 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCSO14618 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCSO14618 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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