Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPB1P53618 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB1P53618 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB1P53618 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB1P53618 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms