Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N6

Syt8, Synaptotagmin-8, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt8Q9R0N6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt8Q9R0N6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt8Q9R0N6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt8Q9R0N6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syt8Q9R0N6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms