Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-207ENST00000511352 572 ntTSL 321.76■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-205ENST00000507686 540 ntTSL 49.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.428e-7■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.138e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.75■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 38.6
FAM120AQ9NZB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-214ENST00000532590 674 ntTSL 26.79□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 416.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 ERMP1-206ENST00000489219 3293 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.642e-20■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 FBXL19-209ENST00000566320 546 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 319.87■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 38.2
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.215e-12■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.254e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 MYH9-210ENST00000486218 788 ntTSL 321.02■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-205ENST00000527014 580 ntTSL 420.64■□□□□ 0.894e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-209ENST00000532479 580 ntTSL 420.16■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.84e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-204ENST00000484238 2422 ntTSL 517.63■□□□□ 0.414e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 MYH9-208ENST00000475726 768 ntTSL 317.36■□□□□ 0.374e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-205ENST00000425546 1344 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-209ENST00000462491 938 ntTSL 211.2□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 FAM222A-AS1-203ENST00000541723 871 ntTSL 211.08□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-215ENST00000481852 717 ntTSL 46.13□□□□□ -1.434e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 318.75■□□□□ 0.594e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.43■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.61□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 38
FAM120AQ9NZB2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 37.9
FAM120AQ9NZB2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.4■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.4■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 419.21■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.51■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.97□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.41□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.539e-8■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 RGS12-205ENST00000502947 2237 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 217.46■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 416.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 414.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 222.38■■□□□ 1.171e-15■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.215e-15■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 526.18■■□□□ 1.784e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 222.71■■□□□ 1.234e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.164e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.964e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220.64■□□□□ 0.894e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 417.46■□□□□ 0.394e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 315.89■□□□□ 0.138e-24■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 GPR108-211ENST00000597706 1834 ntTSL 521.99■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-208ENST00000595908 1750 ntTSL 518.68■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-213ENST00000598626 619 ntTSL 317.2■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-203ENST00000537722 619 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-205ENST00000594500 523 ntTSL 316.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-204ENST00000594034 778 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 37.4
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 762 ms