Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Higd1aQ9JLR9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Higd1aQ9JLR9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms