Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx20Q9D2Y5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx20Q9D2Y5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx20Q9D2Y5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snx20Q9D2Y5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms