Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Snx20Q9D2Y5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Snx20Q9D2Y5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Snx20Q9D2Y5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Snx20Q9D2Y5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx20Q9D2Y5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snx20Q9D2Y5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snx20Q9D2Y5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snx20Q9D2Y5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snx20Q9D2Y5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Snx20Q9D2Y5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx20Q9D2Y5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx20Q9D2Y5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snx20Q9D2Y5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx20Q9D2Y5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx20Q9D2Y5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx20Q9D2Y5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx20Q9D2Y5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx20Q9D2Y5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snx20Q9D2Y5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snx20Q9D2Y5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx20Q9D2Y5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx20Q9D2Y5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx20Q9D2Y5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx20Q9D2Y5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx20Q9D2Y5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx20Q9D2Y5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx20Q9D2Y5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx20Q9D2Y5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx20Q9D2Y5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snx20Q9D2Y5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Snx20Q9D2Y5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx20Q9D2Y5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx20Q9D2Y5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx20Q9D2Y5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx20Q9D2Y5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx20Q9D2Y5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx20Q9D2Y5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx20Q9D2Y5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx20Q9D2Y5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx20Q9D2Y5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx20Q9D2Y5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx20Q9D2Y5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx20Q9D2Y5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx20Q9D2Y5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx20Q9D2Y5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx20Q9D2Y5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx20Q9D2Y5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snx20Q9D2Y5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx20Q9D2Y5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx20Q9D2Y5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx20Q9D2Y5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx20Q9D2Y5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snx20Q9D2Y5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snx20Q9D2Y5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Snx20Q9D2Y5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snx20Q9D2Y5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Snx20Q9D2Y5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Snx20Q9D2Y5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Snx20Q9D2Y5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Snx20Q9D2Y5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Snx20Q9D2Y5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx20Q9D2Y5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx20Q9D2Y5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx20Q9D2Y5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx20Q9D2Y5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx20Q9D2Y5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx20Q9D2Y5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx20Q9D2Y5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx20Q9D2Y5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx20Q9D2Y5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx20Q9D2Y5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx20Q9D2Y5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx20Q9D2Y5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx20Q9D2Y5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snx20Q9D2Y5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx20Q9D2Y5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx20Q9D2Y5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx20Q9D2Y5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx20Q9D2Y5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx20Q9D2Y5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx20Q9D2Y5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx20Q9D2Y5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx20Q9D2Y5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx20Q9D2Y5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx20Q9D2Y5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx20Q9D2Y5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx20Q9D2Y5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx20Q9D2Y5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms