Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stx17Q9D0I4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx17Q9D0I4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx17Q9D0I4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx17Q9D0I4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx17Q9D0I4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms