Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Twist2Q9D030 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Twist2Q9D030 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Twist2Q9D030 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Twist2Q9D030 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms