Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp11Q9CZJ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp11Q9CZJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Utp11Q9CZJ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp11Q9CZJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Utp11Q9CZJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms