Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pja2Q80U04 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pja2Q80U04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pja2Q80U04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pja2Q80U04 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms