Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1lQ2KN98 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Specc1lQ2KN98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Specc1lQ2KN98 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Specc1lQ2KN98 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms