Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 PPZ2YDR436W 2133 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 TOP3YLR234W 1971 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 PMA2YPL036W 2844 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 OSM1YJR051W 1506 nt7.73□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 CHA1YCL064C 1083 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 DAL80YKR034W 810 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 MET8YBR213W 825 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 MET13YGL125W 1803 nt7.72□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 HRB1YNL004W 1365 nt7.71□□□□□ -1.17
VPS54Q12071 CKB1YGL019W 837 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 ATP10YLR393W 840 nt7.71□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 GET2YER083C 858 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 YGL081WYGL081W 963 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PUP2YGR253C 783 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 VPS65YLR322W 315 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 YPT10YBR264C 600 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 CDC3YLR314C 1563 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PRC1YMR297W 1599 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 YJL045WYJL045W 1905 nt7.7□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 CTF3YLR381W 2202 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 YDR215CYDR215C 414 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 UME1YPL139C 1383 nt7.69□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 SKP1YDR328C 585 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 DSC3YOR223W 879 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PEX28YHR150W 1740 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PET10YKR046C 852 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 MAS2YHR024C 1449 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PDC5YLR134W 1692 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 CKI1YLR133W 1749 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PMT7YDR307W 1989 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 PRY2YKR013W 990 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 RCF2YNR018W 675 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 NDE1YMR145C 1683 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 BDS1YOL164W 1941 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 OPI1YHL020C 1215 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 SPE4YLR146C 903 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 BEM1YBR200W 1656 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS54Q12071 LEO1YOR123C 1395 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 CYS3YAL012W 1185 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 SNA3YJL151C 402 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YBL111CYBL111C 2004 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ECM10YEL030W 1935 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 PIL1YGR086C 1020 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 CAR2YLR438W 1275 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YPQ1YOL092W 927 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ECM27YJR106W 2178 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 STF1YDL130W-A 261 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YPL264CYPL264C 1062 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ERR3YMR323W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ERR1YOR393W 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 ERR2YPL281C 1314 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 PTH2YBL057C 627 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 MBF1YOR298C-A 456 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YPL067CYPL067C 597 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 RSC9YML127W 1746 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YHR131CYHR131C 2553 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 NAS6YGR232W 687 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 COS10YNR075W 1125 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS54Q12071 RUP1YOR138C 2016 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YMR253CYMR253C 1245 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 SGF73YGL066W 1974 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 LAT1YNL071W 1449 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 CCW12YLR110C 402 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YML122CYML122C 381 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 TRR2YHR106W 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 SNF7YLR025W 723 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YOX1YML027W 1158 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 CST26YBR042C 1194 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YBL113CYBL113C 2379 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YIL108WYIL108W 2091 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 PAB1YER165W 1734 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 HNM1YGL077C 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 YAH1YPL252C 519 nt7.53□□□□□ -1.2
VPS54Q12071 AQR1YNL065W 1761 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 PDA1YER178W 1263 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 YJL213WYJL213W 996 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 ATO2YNR002C 849 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 YNL040WYNL040W 1371 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 PRS4YBL068W 981 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 HXT9YJL219W 1704 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 AFG2YLR397C 2343 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 GUT1YHL032C 2130 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 TPI1YDR050C 747 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 PAM17YKR065C 594 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 YER152CYER152C 1332 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 AFG3YER017C 2286 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 CBK1YNL161W 2271 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 URA1YKL216W 945 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 AIM46YHR199C 933 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 DCR2YLR361C 1737 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 ZIM17YNL310C 525 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 RTC2YBR147W 891 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 NFS1YCL017C 1494 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 TCB1YOR086C 3561 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 snR30snR30 606 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 POB3YML069W 1659 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 ERG24YNL280C 1317 nt7.47□□□□□ -1.21
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