Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 SPG1YGR236C 288 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 DPM1YPR183W 804 nt7.38□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 YJL213WYJL213W 996 nt7.37□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 CCW12YLR110C 402 nt7.37□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 PMP3YDR276C 168 nt7.36□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 Q0010Q0010 387 nt7.36□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 CYS4YGR155W 1524 nt7.36□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 YPQ2YDR352W 954 nt7.35□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 YPR130CYPR130C 408 nt7.35□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 PET10YKR046C 852 nt7.34□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 TOK1YJL093C 2076 nt7.34□□□□□ -1.23
YPQ1Q12010 YHL008CYHL008C 1884 nt7.33□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 GAL83YER027C 1254 nt7.33□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 VPS65YLR322W 315 nt7.33□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 YCL049CYCL049C 939 nt7.33□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 ORT1YOR130C 879 nt7.32□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 AVL9YLR114C 2295 nt7.32□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 TUB1YML085C 1344 nt7.31□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 YOL046CYOL046C 675 nt7.31□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 CIT2YCR005C 1383 nt7.31□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 PMT1YDL095W 2454 nt7.3□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 FCY22YER060W-A 1593 nt7.3□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 CAR2YLR438W 1275 nt7.29□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 RTC4YNL254C 1206 nt7.29□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 CIA1YDR267C 993 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 CKB1YGL019W 837 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 SUN4YNL066W 1263 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 GET4YOR164C 939 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 GNP1YDR508C 1992 nt7.28□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 ERR3YMR323W 1314 nt7.27□□□□□ -1.24
YPQ1Q12010 HBS1YKR084C 1836 nt7.27□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 PUS7YOR243C 2031 nt7.27□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 MIM1YOL026C 342 nt7.27□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 YJL163CYJL163C 1668 nt7.26□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 MET13YGL125W 1803 nt7.26□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 MPE1YKL059C 1326 nt7.26□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 AIM20YIL158W 615 nt7.25□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 HOC1YJR075W 1191 nt7.25□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 RCF2YNR018W 675 nt7.25□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 LIA1YJR070C 978 nt7.24□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 HXK1YFR053C 1458 nt7.24□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 LEO1YOR123C 1395 nt7.23□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 DUR3YHL016C 2208 nt7.23□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 YLR184WYLR184W 348 nt7.23□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 YPR076WYPR076W 375 nt7.23□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 COX15YER141W 1461 nt7.23□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 PLB2YMR006C 2121 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 GPD1YDL022W 1176 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 OPI7YDR360W 435 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 PET117YER058W 324 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 SSC1YJR045C 1965 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 DIA4YHR011W 1341 nt7.22□□□□□ -1.25
YPQ1Q12010 snR4snR4 186 nt7.21□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 MRPL35YDR322W 1104 nt7.2□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 HTZ1YOL012C 405 nt7.2□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 FIT2YOR382W 462 nt7.2□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YAH1YPL252C 519 nt7.2□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 PDC5YLR134W 1692 nt7.19□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 AGX1YFL030W 1158 nt7.19□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 SNF7YLR025W 723 nt7.19□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YMR074CYMR074C 438 nt7.19□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 SCS22YBL091C-A 528 nt7.18□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YPL136WYPL136W 369 nt7.18□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 TOP3YLR234W 1971 nt7.18□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 APE4YHR113W 1473 nt7.17□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 ALD5YER073W 1563 nt7.17□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 PPH21YDL134C 1110 nt7.17□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 SNA3YJL151C 402 nt7.17□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YKL153WYKL153W 510 nt7.17□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 DMC1YER179W 1005 nt7.16□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YNR005CYNR005C 405 nt7.16□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 ERG24YNL280C 1317 nt7.16□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 AFG3YER017C 2286 nt7.16□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 BRN1YBL097W 2265 nt7.16□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 YJR154WYJR154W 1041 nt7.15□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 MRPL19YNL185C 477 nt7.15□□□□□ -1.26
YPQ1Q12010 FMP40YPL222W 2067 nt7.15□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.14□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 MDH1YKL085W 1005 nt7.14□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.13□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 ASR1YPR093C 867 nt7.13□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 HNM1YGL077C 1692 nt7.12□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 RUP1YOR138C 2016 nt7.12□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 RPL2BYIL018W 765 nt7.12□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 RDR1YOR380W 1641 nt7.12□□□□□ -1.27
YPQ1Q12010 CRH1YGR189C 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
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