Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YPT10YBR264C 600 nt8.89□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 TGL5YOR081C 2250 nt8.87□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 UFD1YGR048W 1086 nt8.87□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 DIA4YHR011W 1341 nt8.86□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 QRI5YLR204W 336 nt8.86□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 DPM1YPR183W 804 nt8.86□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 DML1YMR211W 1428 nt8.86□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 PMT7YDR307W 1989 nt8.85□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 MRP7YNL005C 1116 nt8.85□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 YOL046CYOL046C 675 nt8.85□□□□□ -0.99
CTI6Q08923 ADE16YLR028C 1776 nt8.84□□□□□ -1
CTI6Q08923 YKL153WYKL153W 510 nt8.83□□□□□ -1
CTI6Q08923 IMD1YAR073W 1212 nt8.83□□□□□ -1
CTI6Q08923 SCS22YBL091C-A 528 nt8.83□□□□□ -1
CTI6Q08923 YCL049CYCL049C 939 nt8.83□□□□□ -1
CTI6Q08923 GET2YER083C 858 nt8.82□□□□□ -1
CTI6Q08923 YPL136WYPL136W 369 nt8.82□□□□□ -1
CTI6Q08923 PMT1YDL095W 2454 nt8.82□□□□□ -1
CTI6Q08923 HOC1YJR075W 1191 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 YLR030WYLR030W 792 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 ELP6YMR312W 822 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 AOS1YPR180W 1044 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 MET13YGL125W 1803 nt8.8□□□□□ -1
CTI6Q08923 GTB1YDR221W 2109 nt8.79□□□□□ -1
CTI6Q08923 OPI1YHL020C 1215 nt8.79□□□□□ -1
CTI6Q08923 MDH1YKL085W 1005 nt8.79□□□□□ -1
CTI6Q08923 YPR130CYPR130C 408 nt8.79□□□□□ -1
CTI6Q08923 BDS1YOL164W 1941 nt8.79□□□□□ -1
CTI6Q08923 COX15YER141W 1461 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 PFS2YNL317W 1398 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 YPQ2YDR352W 954 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 INM1YHR046C 888 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 PAM17YKR065C 594 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 NME1NME1 340 nt8.78□□□□□ -1
CTI6Q08923 MDH2YOL126C 1134 nt8.77□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 MAS1YLR163C 1389 nt8.76□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YJL163CYJL163C 1668 nt8.76□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YJL213WYJL213W 996 nt8.76□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 MTC6YHR151C 1581 nt8.76□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 HSV2YGR223C 1347 nt8.76□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YHR033WYHR033W 1272 nt8.75□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 LIA1YJR070C 978 nt8.75□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 DAL80YKR034W 810 nt8.75□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 TPO1YLL028W 1761 nt8.75□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 SSC1YJR045C 1965 nt8.75□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 PAB1YER165W 1734 nt8.74□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 HAM1YJR069C 594 nt8.74□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 CCW12YLR110C 402 nt8.74□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt8.73□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 MRPL19YNL185C 477 nt8.73□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 RTC4YNL254C 1206 nt8.73□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 Q0010Q0010 387 nt8.73□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 PEX28YHR150W 1740 nt8.73□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 GPD1YDL022W 1176 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 AGX1YFL030W 1158 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YNL140CYNL140C 570 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 YBL112CYBL112C 318 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 RBS1YDL189W 1374 nt8.72□□□□□ -1.01
CTI6Q08923 FYV1YDR024W 486 nt8.71□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 YDR215CYDR215C 414 nt8.7□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 ERR3YMR323W 1314 nt8.7□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 YDR387CYDR387C 1668 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 GET4YOR164C 939 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 FIT2YOR382W 462 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 YPC1YBR183W 951 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 CIT2YCR005C 1383 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 MCM5YLR274W 2328 nt8.69□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 TUB1YML085C 1344 nt8.68□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 CIA1YDR267C 993 nt8.67□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 YPR076WYPR076W 375 nt8.67□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 YIL177CYIL177C 5277 nt8.67□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 KTR4YBR199W 1395 nt8.66□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 MRPL35YDR322W 1104 nt8.66□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 CDA1YLR307W 906 nt8.65□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 ERV25YML012W 636 nt8.65□□□□□ -1.02
CTI6Q08923 PDC5YLR134W 1692 nt8.65□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 LPD1YFL018C 1500 nt8.64□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 PPH21YDL134C 1110 nt8.64□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 DRE2YKR071C 1047 nt8.64□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 FMP40YPL222W 2067 nt8.64□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 SGF73YGL066W 1974 nt8.64□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 SNA3YJL151C 402 nt8.63□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.62□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 ILV6YCL009C 930 nt8.62□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 CRH1YGR189C 1524 nt8.61□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 PLB2YMR006C 2121 nt8.61□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 ASR1YPR093C 867 nt8.61□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 ALR1YOL130W 2580 nt8.61□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 APE4YHR113W 1473 nt8.6□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 RPL2BYIL018W 765 nt8.6□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 YJR154WYJR154W 1041 nt8.6□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 YMR252CYMR252C 405 nt8.6□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 MPE1YKL059C 1326 nt8.59□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 IMG1YCR046C 510 nt8.59□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 LCL3YGL085W 825 nt8.59□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 AIM34YMR003W 597 nt8.59□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 HTZ1YOL012C 405 nt8.59□□□□□ -1.03
CTI6Q08923 GID7YCL039W 2238 nt8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms