Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 HOC1YJR075W 1191 nt10.62□□□□□ -0.71
GDB1Q06625 DAL80YKR034W 810 nt10.61□□□□□ -0.71
GDB1Q06625 TUB1YML085C 1344 nt10.6□□□□□ -0.71
GDB1Q06625 AGX1YFL030W 1158 nt10.6□□□□□ -0.71
GDB1Q06625 TPO4YOR273C 1980 nt10.59□□□□□ -0.71
GDB1Q06625 CDA1YLR307W 906 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YNL140CYNL140C 570 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 RPL2AYFR031C-A 765 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 RPL2BYIL018W 765 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YJL213WYJL213W 996 nt10.58□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 GET4YOR164C 939 nt10.57□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 BDS1YOL164W 1941 nt10.57□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 MPE1YKL059C 1326 nt10.56□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 MAE1YKL029C 2010 nt10.56□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 COX15YER141W 1461 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YDR215CYDR215C 414 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 HTZ1YOL012C 405 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 LSC1YOR142W 990 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YPR076WYPR076W 375 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 CRH1YGR189C 1524 nt10.55□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt10.54□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YBL112CYBL112C 318 nt10.54□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 KTR4YBR199W 1395 nt10.54□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 FSF1YOR271C 984 nt10.53□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 NBA1YOL070C 1506 nt10.53□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 FYV1YDR024W 486 nt10.53□□□□□ -0.72
GDB1Q06625 YOR200WYOR200W 399 nt10.52□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 FMP40YPL222W 2067 nt10.51□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt10.5□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YKL147CYKL147C 618 nt10.5□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YLR463CYLR463C 552 nt10.5□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YMR252CYMR252C 405 nt10.5□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 CIT2YCR005C 1383 nt10.5□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 PPH21YDL134C 1110 nt10.49□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 FIT2YOR382W 462 nt10.49□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YPQ2YDR352W 954 nt10.48□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 OSW2YLR054C 2175 nt10.47□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 PLB2YMR006C 2121 nt10.47□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt10.47□□□□□ -0.73
GDB1Q06625 IRC7YFR055W 1023 nt10.46□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 DMC1YER179W 1005 nt10.45□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 APE4YHR113W 1473 nt10.45□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 ADE5,7YGL234W 2409 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 RTC4YNL254C 1206 nt10.44□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 ASR1YPR093C 867 nt10.43□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 RBS1YDL189W 1374 nt10.41□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 GPD2YOL059W 1323 nt10.41□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 PET10YKR046C 852 nt10.41□□□□□ -0.74
GDB1Q06625 MED6YHR058C 888 nt10.39□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 MRPS18YNL306W 654 nt10.39□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 LEO1YOR123C 1395 nt10.39□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 AVL9YLR114C 2295 nt10.39□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 ASF1YJL115W 840 nt10.38□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 PEX28YHR150W 1740 nt10.38□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 PET117YER058W 324 nt10.38□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 RCF2YNR018W 675 nt10.38□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 YIP4YGL198W 708 nt10.37□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 CAR2YLR438W 1275 nt10.37□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 YHL008CYHL008C 1884 nt10.36□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 TOP3YLR234W 1971 nt10.35□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 YKL102CYKL102C 306 nt10.35□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt10.35□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 TAF9YMR236W 474 nt10.34□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 MIM1YOL026C 342 nt10.34□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 YAH1YPL252C 519 nt10.34□□□□□ -0.75
GDB1Q06625 SAL1YNL083W 1485 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 snR4snR4 186 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 PMT1YDL095W 2454 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 CKB1YGL019W 837 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 SNA3YJL151C 402 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 YML018CYML018C 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 BRN1YBL097W 2265 nt10.32□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 YCR049CYCR049C 447 nt10.32□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 PRE3YJL001W 648 nt10.31□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 YNR005CYNR005C 405 nt10.31□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 RRP9YPR137W 1722 nt10.31□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 CDC1YDR182W 1476 nt10.31□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 ADE16YLR028C 1776 nt10.31□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 SUF3tG(CCC)D 72 nt10.3□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 NTG2YOL043C 1143 nt10.3□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 COQ3YOL096C 939 nt10.3□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 PDC5YLR134W 1692 nt10.28□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 YNL092WYNL092W 1203 nt10.28□□□□□ -0.76
GDB1Q06625 ORT1YOR130C 879 nt10.28□□□□□ -0.76
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