Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 YKL147CYKL147C 618 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YNL200CYNL200C 741 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 VBA3YCL069W 1377 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 ARP3YJR065C 1350 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 TUB4YLR212C 1422 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 SDS24YBR214W 1584 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 ECM38YLR299W 1983 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 CYC8YBR112C 2901 nt5.86□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 NIF3YGL221C 867 nt5.86□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 GYP8YFL027C 1494 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 MCH2YKL221W 1422 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 TOS1YBR162C 1368 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 GRH1YDR517W 1119 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YFR020WYFR020W 699 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 OLA1YBR025C 1185 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 EXG2YDR261C 1689 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 HXT2YMR011W 1626 nt5.85□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YDR215CYDR215C 414 nt5.84□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 GTT3YEL017W 1014 nt5.84□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 CHS7YHR142W 951 nt5.84□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 PET10YKR046C 852 nt5.84□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 AOS1YPR180W 1044 nt5.84□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 FUN14YAL008W 597 nt5.83□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 CCT3YJL014W 1605 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 ENO1YGR254W 1314 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 CDC3YLR314C 1563 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 CTF8YHR191C 402 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 HAM1YJR069C 594 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 PRY2YKR013W 990 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 LIP5YOR196C 1245 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 HXT8YJL214W 1710 nt5.82□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 TAH11YJR046W 1815 nt5.81□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 CEF1YMR213W 1773 nt5.81□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 CAR2YLR438W 1275 nt5.81□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 MPA43YNL249C 1629 nt5.81□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 SLX5YDL013W 1860 nt5.8□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 YHC3YJL059W 1227 nt5.8□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 FCY22YER060W-A 1593 nt5.8□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 YBR241CYBR241C 1467 nt5.79□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 ERV25YML012W 636 nt5.79□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 NAS2YIL007C 663 nt5.78□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 RPL2BYIL018W 765 nt5.78□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 YAL045CYAL045C 309 nt5.78□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 SUR7YML052W 909 nt5.78□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 ARC35YNR035C 1029 nt5.78□□□□□ -1.48
PKR1Q03880 ISC1YER019W 1434 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 PHO3YBR092C 1404 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 MET22YOL064C 1074 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YOR300WYOR300W 309 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 OPI11YPR044C 354 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 MKK1YOR231W 1527 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 NMT1YLR195C 1368 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 SLA2YNL243W 2907 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 PET494YNR045W 1470 nt5.77□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 SGV1YPR161C 1974 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 HSP12YFL014W 330 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YHR033WYHR033W 1272 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 RAP1YNL216W 2484 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 KNS1YLL019C 2214 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 EFT2YDR385W 2529 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 EFT1YOR133W 2529 nt5.76□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 ADH7YCR105W 1086 nt5.75□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 DST1YGL043W 930 nt5.75□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 CCP1YKR066C 1086 nt5.75□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 SHC1YER096W 1539 nt5.74□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 PUP3YER094C 618 nt5.74□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt5.74□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YAH1YPL252C 519 nt5.74□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 FRE5YOR384W 2085 nt5.74□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 CSC1YLR241W 2349 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YDR327WYDR327W 327 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 FZF1YGL254W 900 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 MTR3YGR158C 753 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 PHB2YGR231C 933 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YJR154WYJR154W 1041 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 BXI1YNL305C 894 nt5.73□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 YGR127WYGR127W 939 nt5.72□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 OPI8YKR035C 642 nt5.72□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 ADH3YMR083W 1128 nt5.72□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 SNT309YPR101W 528 nt5.72□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 RIO1YOR119C 1455 nt5.71□□□□□ -1.49
PKR1Q03880 PXL1YKR090W 2121 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 POP1YNL221C 2628 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 ALT2YDR111C 1524 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 MOB1YIL106W 945 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 YUR1YJL139C 1287 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 RHO1YPR165W 630 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 YKR023WYKR023W 1593 nt5.71□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 CDD1YLR245C 429 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 YBL070CYBL070C 321 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 YNR014WYNR014W 639 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 HBN1YCL026C-B 582 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 OCH1YGL038C 1443 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 HXT15YDL245C 1704 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 HXT16YJR158W 1704 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 YIL055CYIL055C 1884 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 MHP1YJL042W 4197 nt5.7□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 ACS1YAL054C 2142 nt5.69□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 ERS1YCR075C 783 nt5.69□□□□□ -1.5
PKR1Q03880 IGD1YFR017C 588 nt5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms