Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sumo1P63166 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sumo1P63166 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sumo1P63166 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms