Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r1P61809 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cdk5r1P61809 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdk5r1P61809 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r1P61809 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms