Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 RHO1YPR165W 630 nt7.25□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 DCR2YLR361C 1737 nt7.24□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 TCB1YOR086C 3561 nt7.24□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 YHR145CYHR145C 357 nt7.24□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 SGV1YPR161C 1974 nt7.24□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 SHC1YER096W 1539 nt7.23□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 YJL043WYJL043W 774 nt7.23□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.23□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 OCH1YGL038C 1443 nt7.23□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 VBA5YKR105C 1749 nt7.23□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 PPZ2YDR436W 2133 nt7.22□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 MOB1YIL106W 945 nt7.22□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 RFS1YBR052C 633 nt7.22□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 EMP65YER140W 1671 nt7.22□□□□□ -1.25
SSZ1P38788 YMR147WYMR147W 672 nt7.21□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 AOS1YPR180W 1044 nt7.21□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 DAL7YIR031C 1665 nt7.21□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 THI73YLR004C 1572 nt7.2□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 FLC2YAL053W 2352 nt7.2□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 IGD1YFR017C 588 nt7.2□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 SRP102YKL154W 735 nt7.2□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 CAN1YEL063C 1773 nt7.2□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 APM1YPL259C 1428 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 SKY1YMR216C 2229 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 TPI1YDR050C 747 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 HAM1YJR069C 594 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 PET10YKR046C 852 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 VPS65YLR322W 315 nt7.19□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 YEN1YER041W 2280 nt7.18□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 CIR2YOR356W 1896 nt7.18□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 SIR2YDL042C 1689 nt7.18□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 HNM1YGL077C 1692 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 ORM1YGR038W 669 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 RTC2YBR147W 891 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 YLL058WYLL058W 1728 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 ENB1YOL158C 1821 nt7.17□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 TPK1YJL164C 1194 nt7.16□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 HMS2YJR147W 1077 nt7.16□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 YLR280CYLR280C 351 nt7.16□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 MNN9YPL050C 1188 nt7.16□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 MSS51YLR203C 1311 nt7.16□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 CAK1YFL029C 1107 nt7.15□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 YHR033WYHR033W 1272 nt7.15□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 FLX1YIL134W 936 nt7.15□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 INP54YOL065C 1155 nt7.15□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 PRE10YOR362C 867 nt7.15□□□□□ -1.26
SSZ1P38788 TIM50YPL063W 1431 nt7.15□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CIT3YPR001W 1461 nt7.15□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 SRF1YDL133W 1314 nt7.14□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 DST1YGL043W 930 nt7.14□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 DAL4YIR028W 1908 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 ARG7YMR062C 1326 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 YDR215CYDR215C 414 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 YPT31YER031C 672 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 HRA1HRA1 564 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CYC3YAL039C 810 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 YMR166CYMR166C 1107 nt7.13□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CAR2YLR438W 1275 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 OCA1YNL099C 717 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 SLD7YOR060C 774 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 OST3YOR085W 1053 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 RSP5YER125W 2430 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CLN1YMR199W 1641 nt7.12□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 QCR6YFR033C 444 nt7.11□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 YOR300WYOR300W 309 nt7.11□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 ERO1YML130C 1692 nt7.11□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 VMA2YBR127C 1554 nt7.11□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 ATG23YLR431C 1362 nt7.1□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 UTP6YDR449C 1323 nt7.1□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CPR2YHR057C 618 nt7.1□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 NAP1YKR048C 1254 nt7.1□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 YGL260WYGL260W 231 nt7.09□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 CPD1YGR247W 720 nt7.09□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 LOT6YLR011W 576 nt7.09□□□□□ -1.27
SSZ1P38788 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 COS6YGR295C 1146 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 RRT14YIL127C 621 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 ERV25YML012W 636 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 RQC1YDR333C 2172 nt7.08□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 SEC23YPR181C 2307 nt7.07□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 PMU1YKL128C 888 nt7.07□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 CDC16YKL022C 2523 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 JHD1YER051W 1479 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 YKL147CYKL147C 618 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 BXI1YNL305C 894 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 YOR012WYOR012W 414 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 ELP3YPL086C 1674 nt7.06□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 FCY2YER056C 1602 nt7.05□□□□□ -1.28
SSZ1P38788 YDR327WYDR327W 327 nt7.05□□□□□ -1.28
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