Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	PRY2	YKR013W	990 nt		7.52	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	ADH6	YMR318C	1083 nt		7.52	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	PRS4	YBL068W	981 nt		7.52	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	MCP1	YOR228C	909 nt		7.52	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	CST26	YBR042C	1194 nt		7.52	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	SPS1	YDR523C	1473 nt		7.51	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	AAD14	YNL331C	1131 nt		7.51	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	DSC3	YOR223W	879 nt		7.51	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	ILV2	YMR108W	2064 nt		7.5	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	GET2	YER083C	858 nt		7.5	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	YHR033W	YHR033W	1272 nt		7.5	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	CYS3	YAL012W	1185 nt		7.5	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	YBL113C	YBL113C	2379 nt		7.5	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	PIL1	YGR086C	1020 nt		7.49	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	YLR030W	YLR030W	792 nt		7.49	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	PPZ2	YDR436W	2133 nt		7.49	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	SPE4	YLR146C	903 nt		7.48	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	YOR111W	YOR111W	699 nt		7.48	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	ITR1	YDR497C	1755 nt		7.48	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	BEM1	YBR200W	1656 nt		7.47	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	CHA1	YCL064C	1083 nt		7.47	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	MBF1	YOR298C-A	456 nt		7.47	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	YPC1	YBR183W	951 nt		7.47	□□□□□ -1.21
ATG12	P38316	PET10	YKR046C	852 nt		7.46	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	YML122C	YML122C	381 nt		7.46	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	LGE1	YPL055C	999 nt		7.46	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	YDR215C	YDR215C	414 nt		7.45	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	SKP1	YDR328C	585 nt		7.45	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	PAM17	YKR065C	594 nt		7.45	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	SPE3	YPR069C	882 nt		7.45	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	MCM5	YLR274W	2328 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	DAL80	YKR034W	810 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	YNL190W	YNL190W	615 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	PUS4	YNL292W	1212 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	HNM1	YGL077C	1692 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	DML1	YMR211W	1428 nt		7.44	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	MET30	YIL046W	1923 nt		7.43	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	ZIM17	YNL310C	525 nt		7.43	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	DCR2	YLR361C	1737 nt		7.42	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	GNA1	YFL017C	480 nt		7.42	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	CAR2	YLR438W	1275 nt		7.42	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	YOR041C	YOR041C	432 nt		7.42	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	RFC1	YOR217W	2586 nt		7.42	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	MAL31	YBR298C	1845 nt		7.41	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	PLB3	YOL011W	2061 nt		7.4	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	TPI1	YDR050C	747 nt		7.4	□□□□□ -1.22
ATG12	P38316	DTR1	YBR180W	1719 nt		7.4	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	TCB1	YOR086C	3561 nt		7.39	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	GTB1	YDR221W	2109 nt		7.39	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	NFS1	YCL017C	1494 nt		7.39	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	SNF7	YLR025W	723 nt		7.39	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	GAL2	YLR081W	1725 nt		7.38	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	YPQ2	YDR352W	954 nt		7.38	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	YDR510C-A	YDR510C-A	117 nt		7.38	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	SRY1	YKL218C	981 nt		7.38	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	LAS17	YOR181W	1902 nt		7.38	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	OPI1	YHL020C	1215 nt		7.37	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	YJL213W	YJL213W	996 nt		7.37	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	TUB1	YML085C	1344 nt		7.36	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	HEM14	YER014W	1620 nt		7.36	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	YKR018C	YKR018C	2178 nt		7.36	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	SML1	YML058W	315 nt		7.35	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	CCW12	YLR110C	402 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	ATP10	YLR393W	840 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	YAH1	YPL252C	519 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	snR30	snR30	606 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	RTC2	YBR147W	891 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	BDS1	YOL164W	1941 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	CDC23	YHR166C	1881 nt		7.34	□□□□□ -1.23
ATG12	P38316	ERR3	YMR323W	1314 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	ERR1	YOR393W	1314 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	ERR2	YPL281C	1314 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	TOK1	YJL093C	2076 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YLR162W	YLR162W	357 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YMR253C	YMR253C	1245 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	MAS1	YLR163C	1389 nt		7.33	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	RMD8	YFR048W	1989 nt		7.32	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	TOP3	YLR234W	1971 nt		7.32	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	MPH3	YJR160C	1809 nt		7.31	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	GTS1	YGL181W	1191 nt		7.31	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	BIO3	YNR058W	1443 nt		7.31	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	CIT2	YCR005C	1383 nt		7.31	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	NAF1	YNL124W	1479 nt		7.3	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	PDA1	YER178W	1263 nt		7.3	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YGL260W	YGL260W	231 nt		7.3	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	CYS4	YGR155W	1524 nt		7.3	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	MSS51	YLR203C	1311 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	AFG3	YER017C	2286 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	FLC2	YAL053W	2352 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	LDB7	YBL006C	543 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	ERG10	YPL028W	1197 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	SEC24	YIL109C	2781 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	PRB1	YEL060C	1908 nt		7.29	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YDR327W	YDR327W	327 nt		7.28	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YKL147C	YKL147C	618 nt		7.28	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	MPE1	YKL059C	1326 nt		7.27	□□□□□ -1.24
ATG12	P38316	YER137C	YER137C	447 nt		7.27	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	GET4	YOR164C	939 nt		7.27	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	YPR130C	YPR130C	408 nt		7.27	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	DPM1	YPR183W	804 nt		7.27	□□□□□ -1.25

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