Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRR3A8MPY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABRR3A8MPY1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRR3A8MPY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRR3A8MPY1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms