Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TrdcA0A0G2JEU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrdcA0A0G2JEU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdcA0A0G2JEU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdcA0A0G2JEU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms